企业的电子商务系统按系统的功能目标不同，可以分为对企业电子商务活动的内容管理、协同处理与交易服务三类。
1．内容管理这类电子商务系统对企业需要在网上发布的各种信息进行管理，通过在网上的广告信息来增加企业产品的品牌价值，在网上树立企业的形象，扩大公司的影响。

2．协同处理

这类电子商务系统能与公司人员协同工作，自动处理电子商务的业务流程，对企业内外的各组织进行随时的紧密联系。包括收发电子邮件、合同的审定及签署等合同管理，使网上的销售过程自动化。

3．交易服务
这是网上商店常采用的电子商务系统形式，使网上的商品销售活动真正实现每周7天、每天24小时的服务。这种形式的电子商务系统能在网上向客户提供智能目录、接受网上定单和安全的网上支付等服务功能。
1.3.4 按电子商务技术标准和支付方式分类
按技术标准和支付方式可将电子商务分为以下五种。
1．支付系统无安全措施型的电子商务
用户从商家订货，信用卡信息通过电话、传真等非网上传送手段进行传输；也可在网上传送信用卡信息，但无安全措施。商家与银行之间使用各自现有的授权来检查的网络。其特点是风险由商家承担；信用卡信息可以在线传送，但无安全措施。
2．通过第三方经纪人支付型的电子商务
用户在第三方网上经纪人付费系统服务器上开一个账号，用户使用账号付费，交易成本很低，对小额交易很适用。网上经纪人持有用户账号和信用卡号，用户用账号从商家订货，商家将用户账号提供给经纪人，经纪人验证商家身份，给用户发送
E-mail，要求用户确认购买和支付后，将信用卡信息传给银行，完成支付过程。其特点是用户账号的开设不通过网络；信用卡信息不在开放的网络上传送；使用E-mail来确认用户身份，防止伪造；商家自由度大，无风险；支付是通过双方都信任的第三方（经纪人）完成的。
3．电子现金支付型的电子商务
用户用现金服务器账号中预先存入的现金来购买电子货币证书，这些电子货币就有了价值，可以在商业领域中进行流通，电子货币的主要优点是匿名性，缺点是需要一个大型的数据库存储用户完成的交易和电子现金序列号以防止重复消费。这种模式适用于小额交易。
4．支付系统使用简单加密型的电子商务
使用这种模式付费时，用户信用卡号码被加密。采用的加密技术有加密的HTTP协议（Security Hypertext Transfer Protocol，SHTTP）、加密套接字协议层（Security Socket Layer, SSL）等。这种加密的信息只有业务提供商或第三方付费处理系统能够识别。由于用户进行在线购物时只需一个信用卡号，所以这种付费方式给用户带来方便。这种方式需要一系列的加密、授权、认证及相关信息传送，交易成本较高，所以对小额交易而言是不适用的。其特点是部分或全部信息加密；使用对称和非对称加密技术；可能使用身份验证证书；采用防伪造的数字签名。

5．SET（Security Electronic Transfer，安全传输协议）型的电子商务 SET协议是安全电子交易的简称，它是一个在开放网（Internet）上实现安全电子交易的协议标准。SET协议规定了交易各方进行安全交易的具体流程。SET通过使用公共密钥和对称密钥方式加密保证了数据的保密性，通过使用数字签名来确定数据是否被篡改、保证数据的一致性和完整性，并可以完成交易防抵赖。此种方式的电子商务的支付安全有很高的保障，但SET协议十分复杂，因而其应用也受到了一定的限制，不过业界认为这种方式将是未来的发展方向。

1.3.5按电子商务信息网络范围分类

按开展电子商务的信息网络范围，可主要分为三类。
1．本地电子商务
通常是指利用本城市内或本地区内的信息网络实现的电子商务活动，电子交易的地域范围较小。本地电子商务系统是利用Internet、Intranet或专用网将下列系统联结在一起的网络系统：参加交易各方的电子商务信息系统，包括买方、卖方及其他各方的电子商务信息系统；银行金融机构电子信息系统；保险公司信息系统；商品检验信息系统；税务管理信息系统；货物运输信息系统；本地区EDI中心系统（实际上，本地区EDI中心系统联结各个信息系统的中心）。本地电子商务系统是开展有远程国内电子商务和全球电子商务的基础系统。
2．远程国内电子商务
是指在本国范围内进行的网上电子交易活动，其交易的地域范围较大，对软硬件和技术要求较高，要求在全国范围内实现商业电子化、自动化，实现金融电子化，交易各方具备一定的电子商务知识、经济能力和技术能力，并具有一定的管理水平和能力等。
3．全球电子商务
是指在全世界范围内进行的电子交易活动，参加电子交易各方通过网络进行贸易。涉及到有关交易各方的相关系统，如买方国家进出口公司系统、海关系统、银行金融系统、税务系统、运输系统、保险系统等。全球电子商务业务内容繁杂，数据来往频繁，要求电子商务系统严格、准确、安全、可靠，应制订出世界统一的电子商务标准和电子商务（贸易）协议，使全球电子商务得到顺利发展。
此外，电子商务的分类方式还有很多，如按电子商务交易过程分为：交易前电子商务、交易中电子商务和交易后电子商务；按交易对象不同分为：有形商品交易电子商务、无形商品电子商务和服务交易电子商务，等等。应该说，不同的分类便于从不同的角度研究电子商务，对于电子商务研究都有一定的作用。